虽然技术分析可以应用于任何自由交易的证券，但它仍有自己的局限性。在受到强烈的外部操纵的市场中，技术分析是不可行的。例如，许多国家的中央银行一次又一次地干涉其货币市场以维系其汇率稳定。有趣的是，在某些国家，交易者声称已经能够成功地预测干涉，特别是在那些中央银行本身自己就在运用技术分析的国家。技术分析也受限于非流动性的市场，在那些市场中，微量的交易都会对价格造成过度的影响。例如，技术分析运用在发行量很大的本国证券就比运用在发行量很小的存托凭证上更有效。 [2] 另一个技术分析或许会得出错误指示的例子是：一个公司如果已经宣称破产并宣称其股票在重组中一文不值，此时，一个积极的技术分析信号或许会出现，告诉空头的投资者买入股份平仓。

技术分析优于基本面分析的一个最好的例子就是当证券欺诈出现的时候，如已经发生过的安然公司和世通公司。这些公司发布了虚假的财务报表，许多基本面分析师仍然在股价下跌时继续对公司的股票看好。与此同时，一小部分投资者不同意这种观点，并大量交易该证券。这种结果会得到消极的图表模式，并能被技术分析师识别。